MyISAM,InnoDBについて
メリデメ
InnoDBのメリット
InnoDBのデメリット
余程のことが無い限り全文検索や参照テーブルの圧縮といったことは行わないはずなので、MyISAMのみの性能を重視するメリットは正直薄いのかなと思います。またInnoDBのメリット/デメリットの項目を見ても利用する価値はInnoDBの方が高いと言えそうです。今後はInnoDBを使いましょう。参照する場合のポイントはクラスタインデックスの利用などでしょうか。自分は思いつかなかったのですが、マスターをInnoDBで、スレーブをMyISAMで構築したらいいという話があるようなのですが、http://opendatabaselife.blogspot.com/2009/08/innodbmyisam.html こちらのサイトでロックの観点/スレーブからマスターへ移すときの難点が書かれています。